2013年12月31日火曜日

論文12/30/13

Nature
Prefrontal parvalbumin interneurons shape neuronal activity to drive fear expression
Julien Courtin, Fabrice Chaudun, Robert R. Rozeske, Nikolaos Karalis, Cecilia Gonzalez-Campo, Hélène Wurtz, Azzedine Abdi, Jerome Baufreton, Thomas C. M. Bienvenu & Cyril Herry

Parvalbumin-expressing basket-cell network plasticity induced by experience regulates adult learning
Flavio Donato, Santiago Belluco Rompani & Pico Caroni

Science
Long-Distance Integration of Nuclear ERK Signaling Triggered by Activation of a Few Dendritic Spines
Shenyu Zhai, Eugene D. Ark, Paula Parra-Bueno, Ryohei Yasuda

Neural Activity in Human Hippocampal Formation Reveals the Spatial Context of Retrieved Memories
Jonathan F. Miller, Markus Neufang, Alec Solway, Armin Brandt, Michael Trippel, Irina Mader, Stefan Hefft, Max Merkow, Sean M. Polyn, Joshua Jacobs, Michael J. Kahana, Andreas Schulze-Bonhage

Though They May Be Unaware, Newlyweds Implicitly Know Whether Their Marriage Will Be Satisfying
James K. McNulty, Michael A. Olson, Andrea L. Meltzer, Matthew J. Shaffer

Oscillatory Control of Factors Determining Multipotency and Fate in Mouse Neural Progenitors
Itaru Imayoshi, Akihiro Isomura, Yukiko Harima, Kyogo Kawaguchi, Hiroshi Kori, Hitoshi Miyachi, Takahiro Fujiwara, Fumiyoshi Ishidate, Ryoichiro Kageyama

Neuron
Cingulate-Hippocampus Coherence and Trajectory Coding in a Sequential Choice Task
Miguel Remondes, Matthew A. Wilson

Nature Neuroscience
Integration of visual motion and locomotion in mouse visual cortex
Aman B Saleem, Asli Ayaz, Kathryn J Jeffery, Kenneth D Harris and Matteo Carandini

Parental olfactory experience influences behavior and neural structure in subsequent generations
Brian G Dias and Kerry J Ressler

Maternal hematopoietic TNF, via milk chemokines, programs hippocampal development and memory
Bingfang Liu, Bojana Zupan, Emma Laird, Shifra Klein, Georgia Gleason et al.

2013年12月28日土曜日

今年のまとめ

ひとことで言うと、自分はまだまだだと思い知った1年でした。

ただ、何か近いところへは来ているという感覚もあります。
来年は転機の一年にしたいですね。

2013年12月22日日曜日

進行状況

いろいろな方々のお力添えで、マイ二光子顕微鏡のための除振台がようやく先週設置されました。
これからが楽しみです。

2013年12月16日月曜日

matlabの図を論文用に出力する

いろいろな人に聞いたところ、matlabのfigureは「eps形式で保存してAdobe Illustratorで加工する」という人が多かったです。

出版のための微妙かつ度重なる修正のことを考えると、いきなりeps形式で出力するのではなく、いったん.fig形式で保存した後、figure inspectorで好みの見え方に調整してからeps形式で保存するほうが良さそうですね。

2013年12月2日月曜日

論文12/2/13

Nature Neuroscience
Spontaneous cortical activity alternates between motifs defined by regional axonal projections 
Majid H Mohajerani, Allen W Chan, Mostafa Mohsenvand, Jeffrey LeDue, Rui Liu et al.

ReaChR: a red-shifted variant of channelrhodopsin enables deep transcranial optogenetic excitation
John Y Lin, Per Magne Knutsen, Arnaud Muller, David Kleinfeld and Roger Y Tsien


Science
Mice Genetically Deficient in Vasopressin V1a and V1b Receptors Are Resistant to Jet Lag
Yoshiaki Yamaguchi et al.

Nature
Dendritic spikes enhance stimulus selectivity in cortical neurons in vivo
Spencer L. Smith, Ikuko T. Smith, Tiago Branco, Michael Häusser

Context-dependent computation by recurrent dynamics in prefrontal cortex
Valerio Mante, David Sussillo, Krishna V. Shenoy & William T. Newsome

Genetic identification of a neural circuit that suppresses appetite
Matthew E. Carter, Marta E. Soden, Larry S. Zweifel, Richard D. Palmiter

The activity-dependent transcription factor NPAS4 regulates domain-specific inhibition
Brenda L. Bloodgood, Nikhil Sharma, Heidi Adlman Browne, Alissa Z. Trepman,Michael E. Greenberg

Cell
Coexpression Networks Implicate Human Midfetal Deep Cortical Projection Neurons in the Pathogenesis of Autism
A. Jeremy Willsey, Stephan J. Sanders, Mingfeng Li, Shan Dong, Andrew T. Tebbenkamp, Rebecca A. Muhle, Steven K. Reilly, Leon Lin, Sofia Fertuzinhos, Jeremy A. Miller, Michael T. Murtha, Candace Bichsel, Wei Niu, Justin Cotney, A. Gulhan Ercan-Sencicek, Jake Gockley, Abha R. Gupta, Wenqi Han, Xin He, Ellen J. Hoffman, Lambertus Klei, Jing Lei, Wenzhong Liu, Li Liu, Cong Lu, Xuming Xu, Ying Zhu, Shrikant M. Mane, Ed S. Lein, Liping Wei, James P. Noonan, Kathryn Roeder, Bernie Devlin, Nenad Sestan, Matthew W. State

Integrative Functional Genomic Analyses Implicate Specific Molecular Pathways and Circuits in Autism

Neelroop N. Parikshak, Rui Luo, Alice Zhang, Hyejung Won, Jennifer K. Lowe, Vijayendran Chandran, Steve Horvath, Daniel H. Geschwind

Nature Methods
Inducible control of gene expression with destabilized Cre
Richard Sando III, Karsten Baumgaertel, Simon Pieraut, Nina Torabi-Rander, Thomas J Wandless et al.


Genetically encoded fluorescent thermosensors visualize subcellular thermoregulation in living cells
Shigeki Kiyonaka, Taketoshi Kajimoto, Reiko Sakaguchi, Daisuke Shinmi, Mariko Omatsu-Kanbe et al. 
 


Neuron
The New Science of Mind and the Future of Knowledge
Eric Kandel


Engineering Approaches to Illuminating Brain Structure and Dynamics
Karl Deisseroth, Mark J. Schnitzer


Memorable Trends
Yadin Dudai, Richard G.M. Morris


Scaling Brain Size, Keeping Timing: Evolutionary Preservation of Brain Rhythms
György Buzsáki, Nikos Logothetis, Wolf Singer


Grid Cells and Neural Coding in High-End Cortices
Edvard I. Moser, May-Britt Moser


Chronic Cellular Imaging of Entire Cortical Columns in Awake Mice Using Microprisms
Mark L. Andermann, Nathan B. Gilfoy, Glenn J. Goldey, Robert N.S. Sachdev, Markus Wölfel, David A. McCormick, R. Clay Reid, Michael J. Levene 

2013年12月1日日曜日

ウワサ話

研究者に限らず人間の一般的な習性かもしれませんが、特にウワサ話の広まり方というのは、自分の関わる話、関わらない話を問わず、スゴいなと思うことがあります。
 
あるときは、私も聞いたことがあるこの業界のかなり限定的な内容の話を、初対面の人の口から聞いてビックリしたことがあります(「どこから聞いとんねん」と)。こういうのの困った点は、一度広まってしまうとその情報が「固定」してしまい、後のアップデートが困難になってしまうことですね(ちなみにそのとき私が聞いた話は「古い方の話」でした)。

実際のところ「研究」という活動は情報戦としての側面もあるので、むしろ研究者は一般の人よりもウワサに敏感なのかもしれません。科学者がある意味で非科学的なコミュニケーションに翻弄されるというのは、皮肉と言うか、おもしろいですね。私個人としては、多少鈍いくらいがちょうどいいのではないかと思っています。